Ähnlich wie bei EMDR wird bei der Brainspotting-Methode ein emotional belastendes Ereignis in Erinnerung gerufen. Dafür folgen die Augen des Klienten einer langsamen Handbewegung oder einem Zeigestab (dem Pointer) in der Hand der Fachperson. Löst ein Punkt im Gesichtsfeld des Klienten eine körperliche Reaktion aus, etwa starkes Blinzeln, ist ein sog. „Brainspot“ gefunden. Die mit dieser Augenposition oder Orientierung verbundene Gehirnaktivität kann nun (un)bewusste Trauma-Erinnerungen gezielt aktivieren. Um diese zu verarbeiten, fokussiert sich der Klient im Folgenden auf innere Abläufe und wird angeleitet, diese wert- und deutungsfrei zu beobachten. Bei diesem Vorgang wird die natürliche Kompetenz des Gehirns zur Selbstregulierung (Homöostase) tiefgreifend und nachhaltig unterstützt. Auch zur Ressourcenaktivierung, etwa über das Suchen, Wahrnehmen und Verankern einer Körperressource, eignet sich die Methode ausgezeichnet.